Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGI3Q8N145 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LGI3Q8N145 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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LGI3Q8N145 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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LGI3Q8N145 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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