Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NIM1KQ8IY84 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NIM1KQ8IY84 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NIM1KQ8IY84 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms