Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMB4Q86W47 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms