Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PNMA8AQ86V59 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms