Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PBRM1Q86U86 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PBRM1Q86U86 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms