Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTF1AQ7RTS3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTF1AQ7RTS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms