Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SV2BQ7L1I2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2BQ7L1I2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2BQ7L1I2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms