Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM5Q71RC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM5Q71RC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms