Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK10Q6ZWH5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK10Q6ZWH5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms