Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM47EQ6ZV65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM47EQ6ZV65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms