Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CD109Q6YHK3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CD109Q6YHK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CD109Q6YHK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms