Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LBX2Q6XYB7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LBX2Q6XYB7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LBX2Q6XYB7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms