Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VITQ6UXI7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VITQ6UXI7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VITQ6UXI7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms