Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHC4Q6S5L8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHC4Q6S5L8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHC4Q6S5L8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms