Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L2Q6R6M4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L2Q6R6M4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms