Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms