Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1Q6PCB7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1Q6PCB7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms