Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.33■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms