Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54Q6NXT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms