Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ55

TTBK2, Tau-tubulin kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK2Q6IQ55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTBK2Q6IQ55 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTBK2Q6IQ55 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms