Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATL3Q6DD88 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL3Q6DD88 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL3Q6DD88 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms