Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC8Q6A555 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC8Q6A555 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC8Q6A555 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms