Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EEF1DP3Q658K8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms