Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf57Q5W0N0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf57Q5W0N0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms