Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46CQ5VWP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46CQ5VWP2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms