Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH2Q5VUJ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH2Q5VUJ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms