Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF20Q5VTR2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF20Q5VTR2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF20Q5VTR2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF20Q5VTR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms