Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRIP1Q5VSL9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms