Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH8Q5T0T0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MARCH8Q5T0T0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms