Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C9orf50Q5SZB4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf50Q5SZB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf50Q5SZB4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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