Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
NHSL1Q5SYE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NHSL1Q5SYE7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms