Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQH8

C6orf136, Uncharacterized protein C6orf136, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136Q5SQH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf136Q5SQH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf136Q5SQH8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms