Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFDP3Q5H9I0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFDP3Q5H9I0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFDP3Q5H9I0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms