Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XKR4Q5GH76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms