Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM61Q5EBN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms