Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF394Q53GI3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF394Q53GI3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms