Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL12Q53G59 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL12Q53G59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms