Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT3Q3SXY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIT3Q3SXY7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIT3Q3SXY7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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