Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NBPF1Q3BBV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF1Q3BBV0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NBPF1Q3BBV0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms