Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMU1Q2TAY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms