Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM71Q2Q1W2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM71Q2Q1W2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms