Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPP1Q16831 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPP1Q16831 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms