Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXD1Q16676 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms