Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FSCN1Q16658 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FSCN1Q16658 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 451.2 ms