Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NCAPD2Q15021 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCAPD2Q15021 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCAPD2Q15021 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms