Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAPGEF1Q13905 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAPGEF1Q13905 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAPGEF1Q13905 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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