Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOFQ13790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOFQ13790 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOFQ13790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOFQ13790 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOFQ13790 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOFQ13790 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOFQ13790 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOFQ13790 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOFQ13790 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOFQ13790 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOFQ13790 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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