Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF3Q13114 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF3Q13114 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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