Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK3Q13003 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK3Q13003 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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