Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFEMP1Q12805 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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